RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SMCO2A6NFE2 343 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PTGS1P23219 599 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ME3Q16798 604 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CDKL5O76039 1030 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ARIH2O95376 493 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LARGE1O95461 756 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 STAM2O75886 525 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS20O76081 388 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 DEXIO95424 95 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ACLYP53396 1101 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 BEX3Q00994 111 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNA10Q16322 511 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GNASQ5JWF2 1037 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 DPF3Q92784 378 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF3C6Q969F1 213 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 STK36Q9NRP7 1315 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQY0 241 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 RABEP1Q15276 862 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 COPS5Q92905 334 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 FERMT2Q96AC1 680 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 C6orf50Q9HD87 102 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ASGR1P07306 291 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 AP3B2Q13367 1082 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 NECAB1Q8N987 351 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ANO3Q9BYT9 981 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 BACH2Q9BYV9 841 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZEB2O60315 1214 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 EVI5O60447 810 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CTDNEP1O95476 244 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GNA11P29992 359 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX17Q15036 470 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LY6KQ17RY6 165 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GNPTABQ3T906 1256 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GH1P01241 217 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CPT1AP50416 773 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PGBD1Q96JS3 809 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM260Q9NX78 707 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP290O15078 2479 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TGFB3P10600 412 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ICAM3P32942 547 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP1Q07960 439 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ST3GAL1Q11201 340 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 MCTP2Q6DN12 878 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 IL27Q8NEV9 243 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 BICD2Q8TD16 824 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 AIFM3Q96NN9 605 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ELP1O95163 1332 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS3O15072 1205 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FIBPO43427 364 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SREBF1P36956 1147 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RTP1P59025 263 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-208ENST00000531226 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.75■■□□□ 1.07
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