RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 BADQ92934 168 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 B4DLN1 442 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ARVCFO00192 962 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 AFG1LQ8WV93 481 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 BMP8BP34820 402 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ITGA7Q13683 1181 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ADAMTS3O15072 1205 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 EPHB4P54760 987 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SP2Q02086 613 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TRAF1Q13077 416 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 RUFY3Q7L099 469 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PGBD1Q96JS3 809 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TBX21Q9UL17 535 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA0355O15063 1070 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SEC24BO95487 1268 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CCND2P30279 289 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CPT1AP50416 773 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 LRCH3Q96II8 777 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TOX2Q96NM4 488 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 A6NJR5 290 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 STXBP3O00186 592 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 ZEB2O60315 1214 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 DTNBO60941 627 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 GH1P01241 217 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MMP3P08254 477 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PSMA5P28066 241 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 SEMA3FQ13275 785 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PHKBQ93100 1093 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 NID2Q14112 1375 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PIK3CDO00329 1044 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 B4GALT4O60513 344 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CD4P01730 458 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CHMP4BP1P59074 171 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TDHQ8IZJ6 230 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CUL5Q93034 780 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 LAMA3Q16787 3333 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CABYRO75952 493 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 RAG1P15918 1043 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 NAPAP54920 295 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 FBXL16Q8N461 479 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM260Q9NX78 707 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-211ENST00000529899 GGPS1O95749 300 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF286BP0CG31 522 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 RCAN1P53805 252 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 NTRK3Q16288 839 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 PKN1Q16512 942 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 KAT2BQ92831 832 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 CYP2C18P33260 490 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 SHHQ15465 462 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-211ENST00000529899 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms