RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528118.5

TMPRSS4-217, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 3,838 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-217ENST00000528118 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ATF3P18847 181 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CTSWP56202 376 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLCB4Q15147 1175 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 KLHL29Q96CT2 875 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 SAAL1Q96ER3 474 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 GGT7Q9UJ14 662 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF233A6NK53 670 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FOXP2O15409 715 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 MMEP08473 750 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 SLCO1A2P46721 670 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 SCTRP47872 440 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 RASGRF1Q13972 1273 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 KRT79Q5XKE5 535 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FUKQ8N0W3 1084 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FBF1Q8TES7 1133 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PSMD1Q99460 953 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.3□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ABCC6O95255 1503 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 UIMC1Q96RL1 719 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NOD2Q9HC29 1040 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PXDNQ92626 1479 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PSEN1P49768 467 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CASP7P55210 303 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DDR1Q08345 913 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CUL1Q13616 776 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 UBE4AQ14139 1066 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC6Q16204 474 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DAPK3O43293 454 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 HSD17B3P37058 310 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 GNAQP50148 359 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 STK4Q13043 487 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ALX1Q15699 326 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 MDM1Q8TC05 714 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.29□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CYP27B1O15528 508 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 HIP1RO75146 1068 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TRIM37O94972 964 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 OR52Z1P0C646 297 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 NEFHP12036 1026 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 RAB17Q9H0T7 212 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 OPLAHO14841 1288 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DIAPH2O60879 1101 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TSPY3P0CV98 308 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TSPY8P0CW00 308 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLTPP55058 493 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 FMO2Q99518 471 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 TRIM7Q9C029 511 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 C6orf50Q9HD87 102 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 AMACRQ9UHK6 382 aa9.28□□□□□ -0.92
TMPRSS4-217ENST00000528118 MCM8Q9UJA3 840 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms