RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 NOD1Q9Y239 953 aa8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 ICAM1P05362 532 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 EDNRBP24530 442 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 SLC16A2P36021 539 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 GPM6BQ13491 265 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 HIC1Q14526 733 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 PTPROQ16827 1216 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 CRBNQ96SW2 442 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 OCEL1Q9H607 264 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 DMDP11532 3685 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.71□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 GBF1Q92538 1859 aa8.71□□□□□ -1.01
CLVS1-211ENST00000524095 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM221A6NGB7 291 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 M0R296 226 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 MBTPS2O43462 519 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 NMT2O60551 498 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 EFCAB14O75071 495 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 LGR5O75473 907 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TSPY3P0CV98 308 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TSPY8P0CW00 308 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CALML3P27482 149 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PTPN5P54829 565 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PPP2R5BQ15173 497 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CLUL1Q15846 466 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 LY6KQ17RY6 165 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM192Q8IY95 271 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 SCFD2Q8WU76 684 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TOP1MTQ969P6 601 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CLDND1Q9NY35 253 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 FAM50BQ9Y247 325 aa8.71□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PARP14Q460N5 1801 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 C5orf42Q9H799 3197 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 M0R2C6 588 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 GFRA3O60609 400 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 RAB11FIP3O75154 756 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 APPP05067 770 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 NOVP48745 357 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 FOXK2Q01167 660 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 ARHGAP1Q07960 439 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PDE4DQ08499 809 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 HYAL1Q12794 435 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PTK7Q13308 1070 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 RPAINQ86UA6 219 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TET1Q8NFU7 2136 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PANK1Q8TE04 598 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 TBC1D5Q92609 795 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 HAS3O00219 553 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 GPAA1O43292 621 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 NCK2O43639 380 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 UPP2O95045 317 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 AMHP03971 560 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 MMP3P08254 477 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 LINC00271P0C7V0 271 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PSEN2P49810 448 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 ZXDAP98168 799 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PDE4BQ07343 736 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 ADAM15Q13444 863 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 CHST3Q7LGC8 479 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 C7orf31Q8N865 590 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-211ENST00000524095 DNERQ8NFT8 737 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms