RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SKOR1P84550 965 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TICAM2Q86XR7 235 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 FAM151AQ8WW52 585 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D4AQ9H788 454 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA7Q8NI08 942 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SLX4Q8IY92 1834 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAB2O43741 272 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 PRDM1O75626 825 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ITFG2Q969R8 447 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 AIFM3Q96NN9 605 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MRIQ9BWK5 157 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 EPN3Q9H201 632 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ATP2C2O75185 946 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 STX17P56962 302 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A14Q15043 492 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC96Q2M329 555 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 HUNKP57058 714 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 WRNIP1Q96S55 665 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 LAMA4Q16363 1823 aa11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 M0R2C6 588 aa11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 UPP2O95045 317 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 PLCB4Q15147 1175 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 WDR78Q5VTH9 848 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP14Q86W24 1093 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 BACH1O14867 736 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 ZMYM6O95789 1325 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-211ENST00000520276 ADM5C9JUS6 153 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 GRIN1Q05586 938 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MYO1EQ12965 1108 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 GRIK5Q16478 980 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 RESP18Q5W5W9 173 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CAGE1Q8TC20 777 aa11.16□□□□□ -0.62
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