RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520064.2

LARP4-208, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4, human

TSL 5

Gene LARP4, Length 2,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LARP4-208	ENST00000520064	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CASP10	Q92851	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CCT7	Q99832	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	DRC3	Q9H069	523 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	STIM2	Q9P246	746 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PTPRT	O14522	1441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CHGB	P05060	677 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	KRT16	P08779	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CPA3	P15088	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MYH8	P13535	1937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	DTNB	O60941	627 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TJP3	O95049	919 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SKI	P12755	728 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZNF18	P17022	549 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CDK17	Q00537	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	DDB1	Q16531	1140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PLCH2	O75038	1416 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064		A8MUI8	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ASMTL	O95671	621 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PYGM	P11217	842 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MUM1	Q2TAK8	710 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	ZBED4	O75132	1171 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	BBOX1	O75936	387 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	MYZAP	P0CAP1	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	GNAT2	P19087	354 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	TMOD1	P28289	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	COPB2	P35606	906 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	COPS2	P61201	443 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	NR1I3	Q14994	352 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LARP4-208	ENST00000520064	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms