RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP33Q8TEY7 942 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM84AQ96KN4 292 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBX22Q9Y458 520 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-410P-201ENST00000517006 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SGSM2O43147 1006 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPHB3P54753 998 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PEX11GQ96HA9 241 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SGPP1Q9BX95 441 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARVCFO00192 962 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 AQP7O14520 342 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSPAN15O95858 294 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SOD2P04179 222 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 C8AP07357 584 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 GLDCP23378 1020 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 DLG4P78352 724 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 EMC4Q5J8M3 183 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 BRAPQ7Z569 592 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEC14L1Q92503 715 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCLYQ96I15 445 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 JAM3Q9BX67 310 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IPPKQ9H8X2 491 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CD320Q9NPF0 282 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 WNT9AO14904 365 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLD2O14939 933 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNQ2O43526 872 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASGRP1O95267 797 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CRTAMO95727 393 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PMLP29590 882 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TXKP42681 527 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TKFCQ3LXA3 575 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 LDHDQ86WU2 507 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 MZB1Q8WU39 189 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ALG1Q9BT22 464 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 FANCLQ9NW38 375 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PALD1Q9ULE6 856 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 N4BP3O15049 544 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 EFCAB14O75071 495 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 DGKIO75912 1065 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB7AO95365 584 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAPGEF3O95398 923 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASMTLO95671 621 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASGR2P07307 311 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 C1QTNF9P0C862 333 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 MC3RP41968 323 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 NCKAP1LP55160 1127 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC9A5Q14940 896 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF124Q15973 351 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 STEAP3Q658P3 488 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 MIB1Q86YT6 1006 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ALG3Q92685 438 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 ENPP3O14638 875 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-410P-201ENST00000517006 TADA3O75528 432 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms