RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 NIM1KQ8IY84 436 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP33Q8TEY7 942 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHAMP1Q96JM3 812 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALG1Q9BT22 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 JAM3Q9BX67 310 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A17Q9H1V8 727 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 IPPKQ9H8X2 491 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLDND1Q9NY35 253 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARCH2Q9P0N8 246 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PQJ5 194 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 B4E1Z4 1266 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 HRKO00198 91 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 TADA3O75528 432 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTRK1P04629 796 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPOP05164 745 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 DBHP09172 617 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 FPR2P25090 351 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRK2P25098 689 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 TACR1P25103 407 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRK3P35626 688 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A11P48066 632 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR1I3Q14994 352 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNMB1Q16558 191 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 EMC4Q5J8M3 183 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 BICRALQ6AI39 1079 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 NETO2Q8NC67 525 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM168AQ92567 244 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXW5Q969U6 566 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 MFSD3Q96ES6 412 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTFR1LQ9H019 292 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTG4Q9NY30 223 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL14Q9P2G3 628 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR14I1A6ND48 311 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSTA4O15217 222 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGSM2O43147 1006 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 DGKIO75912 1065 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 VIL1P09327 827 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGFALSP35858 605 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPKAPK2P49137 400 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 F8W031 263 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABLIM1O14639 778 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 HGSO14964 777 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB7AO95365 584 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 APPP05067 770 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SDHBP21912 280 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF460Q14592 562 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC9A5Q14940 896 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRF1Q5T601 910 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPTNQ6XPR3 784 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 CABP7Q86V35 215 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 OSTM1Q86WC4 334 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF18BQ86Y91 864 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEC14L1Q92503 715 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 PEX11GQ96HA9 241 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNJ15Q99712 375 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms