RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	EFCAB14	O75071	495 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	GH1	P01241	217 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	NHLH1	Q02575	133 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	ORC4	O43929	436 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	NEK9	Q8TD19	979 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	TOMM22	Q9NS69	142 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	INSL6	Q9Y581	213 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	DCX	O43602	365 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	PDHB	P11177	359 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	MBTPS1	Q14703	1052 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	USH1G	Q495M9	461 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	WNT8B	Q93098	351 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	FBXL18	Q96ME1	805 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	DCTPP1	Q9H773	170 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SGMS2-209	ENST00000515332	PSEN2	P49810	448 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	VPS53	Q5VIR6	699 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	PTK7	Q13308	1070 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	DGKD	Q16760	1214 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	POTEB3	A0JP26	581 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF543	Q08ER8	600 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	POTEB	Q6S5H4	581 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	LGR5	O75473	907 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	FGR	P09769	529 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	MFSD10	Q14728	455 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPRO	Q16827	1216 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	RGS22	Q8NE09	1264 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	AMH	P03971	560 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	EPC2	Q52LR7	807 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	BANK1	Q8NDB2	785 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	ZP2	Q05996	745 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	CPVL	Q9H3G5	476 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	COL20A1	Q9P218	1284 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SGMS2-209	ENST00000515332	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	STXBP2	Q15833	593 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	KCNH6	Q9H252	994 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	HAS3	O00219	553 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	F2	P00734	622 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	GPM6B	Q13491	265 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	HIC1	Q14526	733 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	SAMD11	Q96NU1	681 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	FAM50B	Q9Y247	325 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332		H3BNC9	293 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	ALX1	Q15699	326 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SGMS2-209	ENST00000515332	YME1L1	Q96TA2	773 aa		28.48	■■■□□ 2.15

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