RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC27P30260 824 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 LY6KQ17RY6 165 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 TGFB3P10600 412 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 PTGS1P23219 599 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 BMP8BP34820 402 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 ANAPC15P60006 121 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 COPS5Q92905 334 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 A6NJR5 290 aa24.22■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 GDF15Q99988 308 aa24.22■■□□□ 1.47
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SH3BP2-210ENST00000505941 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 ARIH2O95376 493 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 RAG1P15918 1043 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CDK7P50613 346 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CPLX1O14810 134 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 EVCP57679 992 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 FUT2Q10981 343 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRX1Q86UT6 975 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 BARHL2Q9NY43 387 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SMCO2A6NFE2 343 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 ADCY7P51828 1080 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA0355O15063 1070 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
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SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD1Q15327 319 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 DGKDQ16760 1214 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PRO3102Q9H379 93 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 STXBP3O00186 592 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP4BP1P59074 171 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMC6P62333 389 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP1Q07960 439 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 NEDD9Q14511 834 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2SQ16763 222 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 CDHR1Q96JP9 859 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 NID2Q14112 1375 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 FIBPO43427 364 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 MMP3P08254 477 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 MCTP2Q6DN12 878 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 BADQ92934 168 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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