RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 AP3B2Q13367 1082 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 UBE2SQ16763 222 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GNPTABQ3T906 1256 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 TLK2Q86UE8 772 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 WASF1Q92558 559 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GTF3C6Q969F1 213 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.89■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 STK36Q9NRP7 1315 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 COL6A1P12109 1028 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 XBP1P17861 261 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CENPFP49454 3210 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LCTP09848 1927 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ADCY6O43306 1168 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 PPFIA3O75145 1194 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 TGFB3P10600 412 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GNASQ5JWF2 1037 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 NECAB1Q8N987 351 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 PHF24Q9UPV7 400 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.87■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 NLRP5P59047 1200 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 NLRX1Q86UT6 975 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 IL31RAQ8NI17 732 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.86■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LARGE1O95461 756 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GH1P01241 217 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 MCM2P49736 904 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CPT1AP50416 773 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 KCNA10Q16322 511 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GALNT17Q6IS24 598 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 DPF3Q92784 378 aa20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CABYRO75952 493 aa20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ACLYP53396 1101 aa20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CDHR1Q96JP9 859 aa20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ANO3Q9BYT9 981 aa20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 FIBPO43427 364 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CTDNEP1O95476 244 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 ICAM3P32942 547 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LY6KQ17RY6 165 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.83■□□□□ 0.93
C1orf109-212ENST00000498448 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 MYADML2A6NDP7 307 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 MAFGO15525 162 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 KPNA6O60684 536 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 RGS20O76081 388 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 ARIH2O95376 493 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 ASGR1P07306 291 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 LAMC2Q13753 1193 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 GPRASP2Q96D09 838 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 MCM3APO60318 1980 aa20.82■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 ELP1O95163 1332 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 A0A1W2PQY0 241 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 CTAGE5O15320 804 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 EVI5O60447 810 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 SREBF1P36956 1147 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 BEX3Q00994 111 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 NEDD9Q14511 834 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 COPS5Q92905 334 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 FERMT2Q96AC1 680 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 ALG1Q9BT22 464 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.81■□□□□ 0.92
C1orf109-212ENST00000498448 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms