RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf60	Q5U649	245 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZVU0	165 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX11	P35716	441 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK7	P50613	346 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA9	P57773	515 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	REPS2	Q8NFH8	660 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	HERVK_113	Q902F9	699 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM22	K7EJ46	135 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ADD2	P35612	726 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL23	P55773	120 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	BEX3	Q00994	111 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO40	Q9UH90	709 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPK3	Q9Y572	518 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511		F5H6K3	240 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZEB2	O60315	1214 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RABGGTB	P53611	331 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFAIP2	Q03169	654 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRC3	Q07444	240 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY6	O43306	1168 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CABYR	O75952	493 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB10	O96000	172 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP2	P12643	396 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	VAC14	Q08AM6	782 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST13	Q8NET6	341 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CD4	P01730	458 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TFF2	Q03403	129 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLB	Q13191	982 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA7	Q13683	1181 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CTR9	Q6PD62	1173 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TLK2	Q86UE8	772 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	FEM1B	Q9UK73	627 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2A1	O14983	1001 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	HMMR	O75330	724 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RLBP1	P12271	317 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOG	P15173	224 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNQ1	P51787	676 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAD9	Q9H845	621 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	NYAP2	Q9P242	653 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms