RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.2□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.2□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PARP14Q460N5 1801 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM232C9JQI7 657 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TNFRSF10AO00220 468 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 FLOT1O75955 427 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR20EP86478 221 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR20CP86479 221 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR20DP86480 221 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR20BP86481 221 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR20AP86496 221 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NTRK3Q16288 839 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RGMBQ6NW40 437 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RGS22Q8NE09 1264 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PHKBQ93100 1093 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 DDX11Q96FC9 970 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 H3BQV1 296 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 JAK2O60674 1132 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SCG2P13521 617 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SREBF2Q12772 1141 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 HOMER1Q86YM7 354 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 J3QL48 77 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB5O15062 677 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CTDNEP1O95476 244 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NUCB2P80303 420 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NBPF11Q86T75 865 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CYP4X1Q8N118 509 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 MB21D1Q8N884 522 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 KIFC2Q96AC6 838 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 C8orf76Q96K31 380 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ALG1Q9BT22 464 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 ZBED4O75132 1171 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CALML3P27482 149 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SLC16A2P36021 539 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CCL15Q16663 113 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 CYTH3O43739 400 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 STX6O43752 255 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 COPB2P35606 906 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 OAZ1P54368 228 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NAPAP54920 295 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 INHBEP58166 350 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 NOGQ13253 232 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 COG2Q14746 738 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-211ENST00000497210 GALNT17Q6IS24 598 aa11.15□□□□□ -0.62
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