RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491731.1

USP20-207, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-207ENST00000491731 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 MEIS2O14770 477 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 GH1P01241 217 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 CLTBP09497 229 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 FUT2Q10981 343 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 GDF15Q99988 308 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.18■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 ARVCFO00192 962 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PIK3CDO00329 1044 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PSMC6P62333 389 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 UBE2SQ16763 222 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TOX2Q96NM4 488 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 SORBS3O60504 671 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 RGS20O76081 388 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 ITGA7Q13683 1181 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 AFG1LQ8WV93 481 aa15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 A6NJR5 290 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 KPNA6O60684 536 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PPFIA3O75145 1194 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 RAG1P15918 1043 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 BMP8BP34820 402 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 CDK7P50613 346 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 CHMP4BP1P59074 171 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 ARHGAP1Q07960 439 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 FAAP100Q0VG06 881 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 GNPTABQ3T906 1256 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PHKBQ93100 1093 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 PRO3102Q9H379 93 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 BARHL2Q9NY43 387 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.15■□□□□ 0.02
USP20-207ENST00000491731 SMCO2A6NFE2 343 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 STXBP3O00186 592 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 STAM2O75886 525 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 MMP3P08254 477 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 SCG2P13521 617 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 ADCY7P51828 1080 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 EVCP57679 992 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 ANAPC15P60006 121 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 STK3Q13188 491 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 LAMC2Q13753 1193 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 BADQ92934 168 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.14■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 NID2Q14112 1375 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 A0A1W2PPC1 479 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 CPLX1O14810 134 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 SEC24BO95487 1268 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 GGPS1O95749 300 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 TGFB3P10600 412 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 DGKDQ16760 1214 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 NLRX1Q86UT6 975 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 GRIN2DO15399 1336 aa15.13■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.12■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 KIAA0355O15063 1070 aa15.12■□□□□ 0.01
USP20-207ENST00000491731 FIBPO43427 364 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms