RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PQC6	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	OPLAH	O14841	1288 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PKN1	Q16512	942 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	C3	P01024	1663 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	EPHB6	O15197	1021 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PLTP	P55058	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	OR52Z1	P0C646	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	KLRC1	P26715	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	COPB2	P35606	906 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	EVX2	Q03828	476 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MYBL1	P10243	752 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	TECPR2	O15040	1411 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC14	Q15048	493 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	GJA10	Q969M2	543 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MYH8	P13535	1937 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CACNA1F	O60840	1977 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEM	A6NI47	508 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF263	O14978	683 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	IL2RB	P14784	551 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	CHRND	Q07001	517 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	IL17A	Q16552	155 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM107A	O95990	144 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	NEFH	P12036	1026 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	PLS1	Q14651	629 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	CALCRL	Q16602	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	TLR10	Q9BXR5	811 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS3	O15072	1205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS41	P49754	854 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	ALX1	Q15699	326 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ERCC3-208	ENST00000491292	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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