RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CCL23P55773 120 aa32.27■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 BMP2KLQ5H9B9 411 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 NFRKBQ6P4R8 1299 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 CATIPQ7Z7H3 387 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF654Q8IZM8 581 aa32.27■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 CREB3L3Q68CJ9 461 aa32.25■■■□□ 2.75
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HOXB3-211ENST00000490677 SMARCA1P28370 1054 aa32.21■■■□□ 2.75
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HOXB3-211ENST00000490677 ANO2Q9NQ90 1003 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-211ENST00000490677 MRVI1Q9Y6F6 885 aa32.21■■■□□ 2.75
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HOXB3-211ENST00000490677 CASC1Q6TDU7 716 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXB3-211ENST00000490677 SESTD1Q86VW0 696 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXB3-211ENST00000490677 MYLIPQ8WY64 445 aa32.2■■■□□ 2.75
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HOXB3-211ENST00000490677 CCDC69A6NI79 296 aa32.13■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 TGFB3P10600 412 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA3FQ13275 785 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 PTGISQ16647 500 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3CDO00329 1044 aa32.12■■■□□ 2.73
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