RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 SPRED2Q7Z698 418 aa20.34■□□□□ 0.85
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PKDCC-208ENST00000490302 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 RMDN3Q96TC7 470 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 COL20A1Q9P218 1284 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 NEDD4P46934 1319 aa20.34■□□□□ 0.85
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PKDCC-208ENST00000490302 ZNF213O14771 459 aa20.33■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB103AP81534 67 aa20.33■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 KAT14Q9H8E8 782 aa20.33■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.32■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.32■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.32■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.31■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.3■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 TCTN1Q2MV58 587 aa20.29■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 PPTC7Q8NI37 304 aa20.28■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 PXMP2Q9NR77 195 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 TET1Q8NFU7 2136 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 B4E1Z4 1266 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 HAS3O00219 553 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 CFBP00751 764 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF286BP0CG31 522 aa20.27■□□□□ 0.84
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PKDCC-208ENST00000490302 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.27■□□□□ 0.83
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PKDCC-208ENST00000490302 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.27■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 WNT8BQ93098 351 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 AMNQ9BXJ7 453 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 REV3LO60673 3130 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 PPFIA4O75335 1185 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 LGR5O75473 907 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 HSD17B4P51659 736 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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