RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 ARVCFO00192 962 aa28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 TGFB3P10600 412 aa28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 A6NJR5 290 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 MEIS2O14770 477 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 GH1P01241 217 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 CDC27P30260 824 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 CDK7P50613 346 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.02■■■□□ 2.08
EHD1-211ENST00000489379 CLTBP09497 229 aa28.01■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.01■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.01■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 ARIH2O95376 493 aa28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 GNPTABQ3T906 1256 aa28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 USP17L6PQ6QN14 398 aa28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 ITGA7Q13683 1181 aa27.99■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 LY6KQ17RY6 165 aa27.99■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 LTBP2Q14767 1821 aa27.99■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PTGS1P23219 599 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 NAPAP54920 295 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PURAQ00577 322 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 LAMC2Q13753 1193 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 IL31RAQ8NI17 732 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 COPS5Q92905 334 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 BARHL2Q9NY43 387 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0355O15063 1070 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 RGS20O76081 388 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 ARHGAP1Q07960 439 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 MYL3P08590 195 aa27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 FAAP100Q0VG06 881 aa27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 IL17RAQ96F46 866 aa27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.96■■■□□ 2.07
EHD1-211ENST00000489379 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 ICAM3P32942 547 aa27.95■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.95■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 STXBP3O00186 592 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 SCG2P13521 617 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 IFNAR1P17181 557 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 ADCY7P51828 1080 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 PPTC7Q8NI37 304 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 AFG1LQ8WV93 481 aa27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 FIBPO43427 364 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 MMP3P08254 477 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 RAG1P15918 1043 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 DGKDQ16760 1214 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 MCTP2Q6DN12 878 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 NLRX1Q86UT6 975 aa27.93■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 SMCO2A6NFE2 343 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 CD4P01730 458 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 NEDD9Q14511 834 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD1Q15327 319 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 NTRK3Q16288 839 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.92■■■□□ 2.06
EHD1-211ENST00000489379 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms