RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHP1Q99653 195 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBB4AP04350 444 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSEN1P49768 467 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-24P63145 666 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE4DQ08499 809 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35F6Q8N357 371 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM47Q96LD4 638 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PANX2Q96RD6 677 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARD6BQ9BYG5 372 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEIS1O00470 390 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLRC4O43908 158 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLK7P49862 253 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLGAP5Q15398 846 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOXF2Q9BQY4 288 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCC1Q9HA90 598 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCA1BQ9UMX6 200 aa17.31■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOP2P46087 812 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G4AP47712 749 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOVP48745 357 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRB10Q13322 594 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNGA4Q8IV77 575 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUL5Q93034 780 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNMA5Q96PV4 448 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.3■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAS1Q92839 578 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD10Q9NUJ1 306 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E9PMD0 336 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SASH3O75995 380 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PBX1P40424 430 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR16Q569H4 304 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDI2Q9BXS1 227 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.29■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYMKA6NI61 221 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENC1O14682 589 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE6P0CI01 402 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP4BP1P59074 171 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNPY4Q8N129 248 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4A11Q02928 519 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OGFOD1Q8N543 542 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA1Q92805 767 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRC1Q96MC2 740 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM9Q9C026 710 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM170AA1A519 330 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4DLN1 442 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO1CO00159 1063 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.28■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEB3A0JP26 581 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTECB2RU33 542 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFBP00751 764 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCL9Q07325 125 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT17Q6IS24 598 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEBQ6S5H4 581 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLK2Q6UY11 383 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR9Q96QG7 549 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.27■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC26A0AVF1 554 aa17.27■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.27■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RMND1Q9NWS8 449 aa17.27■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.27■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HINFPQ9BQA5 517 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO3Q9BYT9 981 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUGCTQ9HAC7 445 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCS1LQ9Y276 419 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE9A4FU28 777 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP2AO43633 222 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD40Q6AI12 368 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAPH2Q6IBW4 605 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms