RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	NRL	P54845	237 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTO1	P78417	241 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	STK3	Q13188	491 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC23A	Q15436	765 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PERM1	Q5SV97	790 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKS1A	Q92625	1134 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM11	Q96F44	468 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CD209	Q9NNX6	404 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RAI14	Q9P0K7	980 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCF2	Q9UG63	623 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GAK	O14976	1311 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SNED1	Q8TER0	1413 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LDHC	P07864	332 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNAR1	P17181	557 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDX5	P30044	214 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE6B	P35913	854 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK8	P45983	427 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DSC3	Q14574	896 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	STYK1	Q6J9G0	422 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CTR9	Q6PD62	1173 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST3	Q7LGC8	479 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	BRAP	Q7Z569	592 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC6	Q86TZ1	520 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ESR2	Q92731	530 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP45	Q9UL16	551 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BQV1	296 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NPHP1	O15259	732 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB43	O43298	467 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DDAH1	O94760	285 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	UFL1	O94874	794 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PCSK2	P16519	638 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX18	P35713	384 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	USP5	P45974	858 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NOV	P48745	357 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	EHHADH	Q08426	723 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf60	Q5U649	245 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	XKR5	Q6UX68	686 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		6.43	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms