RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 RMND1Q9NWS8 449 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 BRCA2P51587 3418 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF536O15090 1300 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TBX3O15119 743 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CFBP00751 764 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FDX1P10109 184 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CASP1P29466 404 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC25BP30305 580 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SEMA3FQ13275 785 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CUL4BQ13620 913 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 Q4G0T1 1027 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT79Q5XKE5 535 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 STAMQ92783 540 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MTRQ99707 1265 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 STK17AQ9UEE5 414 aa11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEMA6NI47 508 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBED4O75132 1171 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TPM3P06753 285 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 NF2P35240 595 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF76P36508 570 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 DGKZQ13574 1117 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR16Q569H4 304 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PLIN2Q99541 437 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.66□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPFP49454 3210 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ESPNB1AK53 854 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD17B4P51659 736 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 HMGCS2P54868 508 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K9P80192 1104 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 AMPD3Q01432 767 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 GHRHRQ02643 423 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 GRB10Q13322 594 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNB1Q14721 858 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 DRC7Q8IY82 874 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC4DQ8WXI8 215 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D5Q92609 795 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 LENG9Q96B70 501 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM20AQ96MK3 541 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA5Q96PV4 448 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 STK24Q9Y6E0 443 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.65□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.65□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM86B1E9PN63 330 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 VWA5AO00534 786 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ALAS1P13196 640 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 OAZ1P54368 228 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKG1Q13976 671 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 VGLL4Q14135 290 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HYIQ5T013 277 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SV2BQ7L1I2 683 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CPXCR1Q8N123 301 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPC24Q8NBT2 197 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ERMNQ8TAM6 284 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC15Q8TF66 581 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ATG4CQ96DT6 458 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms