RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487471.1

PQLC3-209, Transcript of PQ loop repeat containing 3, human

TSL 2

Gene PQLC3, Length 466 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC3-209	ENST00000487471	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	GMIP	Q9P107	970 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	FAM221A	A4D161	298 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	WDR63	Q8IWG1	891 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	GGT7	Q9UJ14	662 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-209	ENST00000487471	CASZ1	Q86V15	1759 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CYP27B1	O15528	508 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	HMOX1	P09601	288 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	HOXB7	P09629	217 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CTSH	P09668	335 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CDK8	P49336	464 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF428	Q96B54	188 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	IFT57	Q9NWB7	429 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MYH3	P11055	1940 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	EXOC5	O00471	708 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	HPX	P02790	462 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	NR0B2	Q15466	257 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	NUP98	P52948	1817 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471		E9PSI1	815 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	APAF1	O14727	1248 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RGS13	O14921	159 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CLEC3A	O75596	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ATE1	O95260	518 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF853	P0CG23	659 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	HK2	P52789	917 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	GNAI1	P63096	354 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	JAG1	P78504	1218 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	APOBR	Q0VD83	1088 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SPATA32	Q96LK8	384 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	GRIN3B	O60391	1043 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SRF	P11831	508 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	RIPK4	P57078	832 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	TEF	Q10587	303 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	GAB4	Q2WGN9	574 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	ESR1	P03372	595 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MCM4	P33991	863 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-209	ENST00000487471	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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