RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486695.1

KIFC1-213, Transcript of kinesin family member C1, human

TSL 3

Gene KIFC1, Length 667 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC1-213	ENST00000486695	GHRHR	Q02643	423 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	PLS1	Q14651	629 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	STX1A	Q16623	288 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	TREML2	Q5T2D2	321 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	CABP7	Q86V35	215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	MB21D1	Q8N884	522 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	CALML4	Q96GE6	196 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC1-213	ENST00000486695	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.21	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		10.21	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	NFIB	O00712	420 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	EDIL3	O43854	480 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SMC2	O95347	1197 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SLFN14	P0C7P3	912 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	RLF	Q13129	1914 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	POSTN	Q15063	836 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	PRR16	Q569H4	304 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	KRT79	Q5XKE5	535 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	NSMF	Q6X4W1	530 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	REPS2	Q8NFH8	660 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM20A	Q96MK3	541 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SLC26A4	O43511	780 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CETP	P11597	493 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	NLRP12	P59046	1061 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	PNOC	Q13519	176 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CST9	Q5W186	159 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	HAS1	Q92839	578 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695		A0A087X0B3	334 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CDC25A	P30304	524 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	COPB2	P35606	906 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	AFM	P43652	599 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	GTF2A2	P52657	109 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	HERVK_113	P62684	666 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	UBXN2A	P68543	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	E2F4	Q16254	413 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC1-213	ENST00000486695	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78

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