RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.97□□□□□ -1.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLSCR1O15162 318 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 BMP5P22003 454 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF445P59923 1031 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FIBCD1Q8N539 461 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEC14L1Q92503 715 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1SP09871 688 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GP6Q9HCN6 339 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.95□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP31Q70CQ4 1352 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 F6X3S4 739 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CR1LQ2VPA4 569 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM89AQ96GI7 184 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.94□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.93□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPHS1O60500 1241 aa5.93□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.93□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM209Q96SK2 561 aa5.93□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WZG4 1122 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SGSM2O43147 1006 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FUCA1P04066 466 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC6A11P48066 632 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRF1Q92994 677 aa5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9IYK1 514 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGA4P13612 1032 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACRV1P26436 265 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADRA1BP35368 520 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAT5AP42229 794 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL17DQ8TAD2 202 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CROTQ9UKG9 612 aa5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 AURKAO14965 403 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAD17O75943 681 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD247P20963 164 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GARTP22102 1010 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEPHS1P49903 392 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL10A1Q03692 680 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF627Q7L945 461 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FUKQ8N0W3 1084 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC9A7Q96T83 725 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.9□□□□□ -1.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROB1E7EW31 1015 aa5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAMP19021 973 aa5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXN1O15353 648 aa5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZSN1 163 aa5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTPALQ9BTX7 342 aa5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.88□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C7orf72A4D263 438 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCAF15Q66K64 600 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.87□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MASP2O00187 686 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms