RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482875.5

MTA3-215, Transcript of metastasis associated 1 family member 3, human

TSL 2

Gene MTA3, Length 2,504 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA3-215	ENST00000482875	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	IFFO2	Q5TF58	517 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ADCY3	O60266	1144 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	AR	P10275	920 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	REST	Q13127	1097 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TRIM29	Q14134	588 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	WASF1	Q92558	559 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PFAS	O15067	1338 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	HOXC6	P09630	235 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81	1e-7	■□□□□ 10.8
MTA3-215	ENST00000482875	GNA11	P29992	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	KIF22	Q14807	665 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	LENG9	Q96B70	501 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TCHH	Q07283	1943 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	EDNRB	P24530	442 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RGS2	P41220	211 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZNF174	Q15697	407 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	APBA2	Q99767	749 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SREBF1	P36956	1147 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	LY6K	Q17RY6	165 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	BRD1	O95696	1058 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	GRIN1	Q05586	938 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PRR16	Q569H4	304 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CLIC4	Q9Y696	253 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	INHA	P05111	366 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	XBP1	P17861	261 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	MCM7	P33993	719 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SP4	Q02446	784 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	GRK4	P32298	578 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CLCN1	P35523	988 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	USP28	Q96RU2	1077 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875		A0A087WWV3	80 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	MYADML2	A6NDP7	307 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	F13A1	P00488	732 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	SMPD1	P17405	629 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	CNGA1	P29973	690 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	COPB2	P35606	906 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	PDE4D	Q08499	809 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	ACVR2B	Q13705	512 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MTA3-215	ENST00000482875	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81

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