RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	FGB	P02675	491 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	SMPD1	P17405	629 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	RAB30	Q15771	203 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	KCTD1	Q719H9	257 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		10.17	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MYH4	Q9Y623	1939 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	TSPY2	A6NKD2	308 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	FOXP2	O15409	715 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	AP1G2	O75843	785 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PTGS1	P23219	599 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	NOV	P48745	357 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	FSD1	Q9BTV5	496 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	B4GALT4	O60513	344 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	NMT2	O60551	498 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	ICAM1	P05362	532 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CCL23	P55773	120 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	SNAP25	P60880	206 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	NSMF	Q6X4W1	530 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBE2F-222	ENST00000482096	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ORC4	O43929	436 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	FGR	P09769	529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	JUND	P17535	347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	PSMC6	P62333	389 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	VWCE	Q96DN2	955 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	MX1	P20591	662 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	IGFBP4	P22692	258 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	ALX1	Q15699	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC96	Q2M329	555 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	SCLY	Q96I15	445 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2F-222	ENST00000482096	NFIB	O00712	420 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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