RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480038.1

FBXO11-208, Transcript of F-box protein 11, human

TSL 4

Gene FBXO11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO11-208	ENST00000480038	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQ27	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQ64	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQC6	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQD8	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	KCNH1	O95259	989 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	KDM5C	P41229	1560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CTSW	P56202	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038		B2RBV5	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	KLF4	O43474	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SUSD5	O60279	629 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	DDAH1	O94760	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CAPNS1	P04632	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	PAM	P19021	973 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NR1I3	Q14994	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	N4BP3	O15049	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	CYBB	P04839	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	ITGAV	P06756	1048 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	YY1	P25490	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SCRN1	Q12765	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	MMP19	Q99542	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	EPN3	Q9H201	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	LRP6	O75581	1613 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FBXO11-208	ENST00000480038	GJB6	O95452	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SCG5	P05408	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DBH	P09172	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	GLI4	P10075	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	HOXA5	P20719	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	HOXC12	P31275	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SV2C	Q496J9	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SYNM	O15061	1565 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	LRP5	O75197	1615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	C7orf72	A4D263	438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TBX1	O43435	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	THBD	P07204	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PLS3	P13797	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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