RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	MMP3	P08254	477 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	INCENP	Q9NQS7	918 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	GH1	P01241	217 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ZP2	Q05996	745 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ARHGAP1	Q07960	439 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	BANK1	Q8NDB2	785 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.47	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ORC4	O43929	436 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	LGR5	O75473	907 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	AMH	P03971	560 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	PSEN2	P49810	448 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	PTK7	Q13308	1070 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	MBTPS1	Q14703	1052 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	DGKD	Q16760	1214 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	LY6K	Q17RY6	165 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	RGS22	Q8NE09	1264 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		12.46	□□□□□ -0.41
APTX-222	ENST00000478279		H3BNC9	293 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	FGR	P09769	529 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	GPM6B	Q13491	265 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ALG1	Q9BT22	464 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	MAF1	Q9H063	256 aa		12.45	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	CFAP54	Q96N23	3096 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	HAS3	O00219	553 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	FOXP2	O15409	715 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	PDHB	P11177	359 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	IRS1	P35568	1242 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	WNT8B	Q93098	351 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	TECTA	O75443	2155 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.44	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	CACNA1H	O95180	2353 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	NCK2	O43639	380 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	F2	P00734	622 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ZNF543	Q08ER8	600 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	MFSD10	Q14728	455 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	STXBP2	Q15833	593 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	TMEM192	Q8IY95	271 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	ANKS1A	Q92625	1134 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	FSD1	Q9BTV5	496 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	DCTPP1	Q9H773	170 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	CLDND1	Q9NY35	253 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		12.43	□□□□□ -0.42
APTX-222	ENST00000478279	DMD	P11532	3685 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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