RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476613.1

IRF1-209, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene IRF1, Length 523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-209ENST00000476613 EMSYQ7Z589 1322 aa9.53□□□□□ -0.88
IRF1-209ENST00000476613 AMHP03971 560 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TSPY3P0CV98 308 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TSPY8P0CW00 308 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 NUBP1P53384 320 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 PDE4BQ07343 736 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 PDE4DQ08499 809 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 PTK7Q13308 1070 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.52□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.52□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 TCF15Q12870 199 aa9.51□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.51□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.51□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 M0R296 226 aa9.5□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 PRDM1O75626 825 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 CHGBP05060 677 aa9.5□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 MMP3P08254 477 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 LTBRP36941 435 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 NOVP48745 357 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TDO2P48775 406 aa9.5□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 C7orf31Q8N865 590 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 DCAF4Q8WV16 495 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TOP1MTQ969P6 601 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 CLDND1Q9NY35 253 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 PROB1E7EW31 1015 aa9.49□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 NFIBO00712 420 aa9.49□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 GH1P01241 217 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 NEFLP07196 543 aa9.49□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 DGKDQ16760 1214 aa9.49□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 IER5LQ5T953 404 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.49□□□□□ -0.89
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IRF1-209ENST00000476613 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 KCTD1Q719H9 257 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 FBXL6Q8N531 539 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 RGS22Q8NE09 1264 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 ANKS1AQ92625 1134 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 KAT2BQ92831 832 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 COPS5Q92905 334 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF1-209ENST00000476613 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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