RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476564.5

MTERF4-215, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

TSL 2

Gene MTERF4, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-215	ENST00000476564	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	MEIS1	O00470	390 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	TBX3	O15119	743 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	NEMF	O60524	1076 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	COBL	O75128	1261 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	PPP6R2	O75170	966 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	ITGB5	P18084	799 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	CAP1	Q01518	475 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	IRF5	Q13568	498 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-215	ENST00000476564	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.71	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FIBP	O43427	364 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	RGS20	O76081	388 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	PGK2	P07205	417 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	NR3C2	P08235	984 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	POTED	Q86YR6	584 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	HAS1	Q92839	578 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	APBA2	Q99767	749 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SPTLC2	O15270	562 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TRPA1	O75762	1119 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	CCND2	P30279	289 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MCM7	P33993	719 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	PTGDR	Q13258	359 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564		A0A1W2PQ27	194 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564		A0A1W2PQ64	194 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564		A0A1W2PQD8	194 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	GPR25	O00155	361 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ICAM3	P32942	547 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MCM4	P33991	863 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FCGRT	P55899	365 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	UBXN2A	P68543	259 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SP3	Q02447	781 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	STK38	Q15208	465 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF174	Q15697	407 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	IL17A	Q16552	155 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	ASB14	A6NK59	587 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	MSH4	O15457	936 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	GNRH1	P01148	92 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-215	ENST00000476564	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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