RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 GH1P01241 217 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 PFKMP08237 780 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ACTN1P12814 892 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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ACTB-209ENST00000473257 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.1□□□□□ -0.31
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ACTB-209ENST00000473257 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.1□□□□□ -0.31
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ACTB-209ENST00000473257 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.09□□□□□ -0.31
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ACTB-209ENST00000473257 RGS20O76081 388 aa13.08□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 STXBP2Q15833 593 aa13.08□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 SP2Q02086 613 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MFSD10Q14728 455 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.07□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.07□□□□□ -0.32
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ACTB-209ENST00000473257 C7orf31Q8N865 590 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PNMA2Q9UL42 364 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 B4DLN1 442 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 KLRF2D3W0D1 207 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 DGKDQ16760 1214 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.322e-30■■■□□ 14.8
ACTB-209ENST00000473257 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 IWS1Q96ST2 819 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 UBAC1Q9BSL1 405 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-209ENST00000473257 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.06□□□□□ -0.32
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