RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468516.1

FOXN4-204, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

TSL 2

Gene FOXN4, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-204ENST00000468516 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.58□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.58□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CLRN2A0PK11 232 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TPM1P09493 284 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 STK4Q13043 487 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 PTPN21Q16825 1174 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CENPPQ6IPU0 288 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 VCPKMTQ9H867 229 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 PIM2Q9P1W9 311 aa14.57□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FAM160B2Q86V87 743 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 LENG9Q96B70 501 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FAM20AQ96MK3 541 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 GINM1Q9NU53 330 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FCER1AP12319 257 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CAP2P40123 477 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DNM2P50570 870 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 LRRC63Q05C16 580 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CXCL9Q07325 125 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 KCNK18Q7Z418 384 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 MB21D1Q8N884 522 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ANKRD7Q92527 254 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 IQCDQ96DY2 449 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 VPS16Q9H269 839 aa14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RAD21O60216 631 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CASP14P31944 242 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ECE1P42892 770 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ECM1Q16610 540 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ACER1Q8TDN7 264 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DDX12PQ92771 950 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.55□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 WNT10BO00744 389 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 COBLO75128 1261 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ASNSP08243 561 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RETREG2Q8NC44 543 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.54□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 MARCH6O60337 910 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CCDC175P0C221 793 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 UBXN1Q04323 297 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TNIP1Q15025 636 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 USH1GQ495M9 461 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FIGNQ5HY92 759 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ERMNQ8TAM6 284 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ZNF592Q92610 1267 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 DNAJC7Q99615 494 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 NUP58Q9BVL2 599 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 FEM1BQ9UK73 627 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.53□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 RPA1P27694 616 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 GHRHRQ02643 423 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 COASYQ13057 564 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 MIIPQ5JXC2 388 aa14.52□□□□□ -0.08
FOXN4-204ENST00000468516 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms