RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM13O60858 407 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 BMP7P18075 431 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXO4P98177 505 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP4K2Q12851 820 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TESK1Q15569 626 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NTRK3Q16288 839 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 OSBP2Q969R2 916 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PDPK1O15530 556 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NCAM1P13591 858 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 SGSM3Q96HU1 749 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NOX5Q96PH1 765 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 CLDND1Q9NY35 253 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PALD1Q9ULE6 856 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 JAG2Q9Y219 1238 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 X6R8D5 127 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GTL3 188 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FFAR3O14843 346 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MYO1BO43795 1136 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 INHBBP09529 407 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 LSAMPQ13449 338 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 NSMFQ6X4W1 530 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 Q8N1Y9 231 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB7AO95365 584 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 C8BP07358 591 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FGFR1P11362 822 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF2A2P52657 109 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC9A5Q14940 896 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MTERF2Q49AM1 385 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MROH9Q5TGP6 573 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX11Q96FC9 970 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 JAM3Q9BX67 310 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF38Q9H0F5 515 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 CDIP1Q9H305 208 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ADCY3O60266 1144 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SERINC3Q13530 473 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RASGRF1Q13972 1273 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 VWA3BQ502W6 1294 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 STK32CQ86UX6 486 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT8Q8NBV8 401 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SEC14L1Q92503 715 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ASXL2Q76L83 1435 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 H7BY64 318 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 STAT5AP42229 794 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC6A11P48066 632 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 HTRA3P83110 453 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RBL2Q08999 1139 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RASA3Q14644 834 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM209AQ5JX71 171 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNC2Q96PR1 638 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR27Q9NS67 375 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM153BP0C7A2 387 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXA5P20719 270 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms