RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.87□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 PAX7P23759 505 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 HSD17B3P37058 310 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TNNC1P63316 161 aa14.87□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 SLC8A3P57103 927 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PPP2R2AP63151 447 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PDE4DQ08499 809 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 TATDN2Q93075 761 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 RAD51CO43502 376 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CALML3P27482 149 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 E2F5Q15329 346 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 CCT6BQ92526 530 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 BAP1Q92560 729 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.86□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SLC1A4P43007 532 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 STK4Q13043 487 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ABCB11O95342 1321 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 COL18A1P39060 1754 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PP2D1A8MPX8 630 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PALMO75781 387 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SLC5A1P13866 664 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF844Q08AG5 666 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PDXDC1Q6P996 788 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RAPGEF5Q92565 580 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 HVCN1Q96D96 273 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.85□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TMOD1P28289 359 aa14.84□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MAN2A1Q16706 1144 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 BLIDQ8IZY5 108 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 USP38Q8NB14 1042 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 HOOK2Q96ED9 719 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TRIM9Q9C026 710 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PAPPAQ13219 1627 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CES2O00748 559 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ADAMTS3O15072 1205 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ECHS1P30084 290 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 NAB2Q15742 525 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ODF2Q5BJF6 829 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PLIN2Q99541 437 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.84□□□□□ -0.03
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SRPRB-201ENST00000466490 ATP6V1G2O95670 118 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 HGSNATQ68CP4 663 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MSL1Q68DK7 614 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CENPPQ6IPU0 288 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SWAP70Q9UH65 585 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.84□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 OPLAHO14841 1288 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 PPIP5K2O43314 1243 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ORC4O43929 436 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 FTCDO95954 541 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ERVK-9P63128 1117 aa14.83□□□□□ -0.04
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SRPRB-201ENST00000466490 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.83□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.83□□□□□ -0.04
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