RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MCM3P25205 808 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TMC4Q7Z404 712 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CAGE1Q8TC20 777 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MMS19Q96T76 1030 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 JADE2Q9NQC1 790 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 USP40Q9NVE5 1235 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 EDIL3O43854 480 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CASP8Q14790 479 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 HLA-DOAP06340 250 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 USP14P54578 494 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 KCNK18Q7Z418 384 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SP8Q8IXZ3 490 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB5O15062 677 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SLC16A2P36021 539 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 IQCEQ6IPM2 695 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM58Q8NG06 486 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.33■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC41Q15345 812 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 MAP9Q49MG5 647 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 KCTD1Q719H9 257 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 FOCADQ5VW36 1801 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 EPHB6O15197 1021 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 AKR1B10O60218 316 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 TACC1O75410 805 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ERCC3P19447 782 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 KIF11P52732 1056 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 DDR1Q08345 913 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 SEPT2Q15019 361 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 RRAGAQ7L523 313 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 PROM2Q8N271 834 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF263O14978 683 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 SHMT1P34896 483 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 SCNN1DP51172 638 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 GYS2P54840 703 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 COASYQ13057 564 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 CERS5Q8N5B7 392 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 NEK11Q8NG66 645 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 HAS1Q92839 578 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC102AQ96A19 550 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 VPS18Q9P253 973 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC53A6NM62 1247 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 USP17L10C9JJH3 530 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 RAD21O60216 631 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 EHHADHQ08426 723 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC4Q96A65 974 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 G3V3G9 751 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ECM1Q16610 540 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 GJA10Q969M2 543 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 PANK4Q9NVE7 773 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-204ENST00000465425 SH2D4AQ9H788 454 aa20.3■□□□□ 0.84
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