RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 G3V3G9 751 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SMIM22K7EJ46 135 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 WNT7AO00755 349 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PRLRP16471 622 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LMNB1P20700 586 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 USP11P51784 963 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 EMP3P54852 163 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RASSF7Q02833 373 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GABPAQ06546 454 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TERF2Q15554 542 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CALCRLQ16602 461 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LETM2Q2VYF4 491 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MAP9Q49MG5 647 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NIM1KQ8IY84 436 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TBCKQ8TEA7 893 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 POLLQ9UGP5 575 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RAB21Q9UL25 225 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MYO6Q9UM54 1294 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PSME4Q14997 1843 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PDHBP11177 359 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PLCG1P19174 1290 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ASIC1P78348 528 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ITIH3Q06033 890 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SPA17Q15506 151 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 AOC3Q16853 763 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HYIQ5T013 277 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HDXQ7Z353 690 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 JDP2Q8WYK2 163 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CUL5Q93034 780 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MKL1Q969V6 931 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CEP95Q96GE4 821 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SBF1O95248 1867 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MYH1P12882 1939 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TTC26A0AVF1 554 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TBX3O15119 743 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CASP1P29466 404 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZNF543Q08ER8 600 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KIF5AQ12840 1032 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 AP3B2Q13367 1082 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MAN2A1Q16706 1144 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 WDR93Q6P2C0 686 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PODNQ7Z5L7 613 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SLC51AQ86UW1 340 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TRIM58Q8NG06 486 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DCAF4Q8WV16 495 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 STAMQ92783 540 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MTMR8Q96EF0 704 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CEP63Q96MT8 703 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PIGSQ96S52 555 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DESI2Q9BSY9 194 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RNF14Q9UBS8 474 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TSKSQ9UJT2 592 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GDAQ9Y2T3 454 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.47□□□□□ -0.89
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