RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	RPS6KB1	P23443	525 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CPT1A	P50416	773 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARHGAP1	Q07960	439 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	FUT2	Q10981	343 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBE2S	Q16763	222 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TDH	Q8IZJ6	230 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		27.57	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MEIS2	O14770	477 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CABYR	O75952	493 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RAG1	P15918	1043 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CHMP4BP1	P59074	171 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	GH1	P01241	217 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCND2	P30279	289 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		27.55	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A1W2PPC1	479 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPFIA3	O75145	1194 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	EPHB4	P54760	987 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CUL5	Q93034	780 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627		A6NJR5	290 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PSMA5	P28066	241 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SP2	Q02086	613 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		27.53	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LAMA3	Q16787	3333 aa		27.52	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		27.52	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MMP3	P08254	477 aa		27.52	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SHH	Q15465	462 aa		27.52	■■■□□ 2
SH3BP5-208	ENST00000459627	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	B4GALT4	O60513	344 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	CD4	P01730	458 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	SZT2	Q5T011	3432 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	RUFY3	Q7L099	469 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	PIK3CD	O00329	1044 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	GGPS1	O95749	300 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	TIMP1	P01033	207 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2C18	P33260	490 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	NAPA	P54920	295 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	PGBD1	Q96JS3	809 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	STXBP3	O00186	592 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2C9	P11712	490 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	FPGS	Q05932	587 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	KAT2B	Q92831	832 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHKB	Q93100	1093 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	RCAN1	P53805	252 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SH3BP5-208	ENST00000459627	LAMC2	Q13753	1193 aa		27.46	■■□□□ 1.99

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