RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 MOB2Q70IA6 237 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 LPAR1Q92633 364 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 WDR18Q9BV38 432 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TRAF5O00463 557 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CPP00450 1065 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PFKFB1P16118 471 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 MCM7P33993 719 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP14P54578 494 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SPECC1Q5M775 1068 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 RESP18Q5W5W9 173 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 LDHDQ86WU2 507 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TNMDQ9H2S6 317 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 KIF3CO14782 793 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PTGDRQ13258 359 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 UBE2SQ16763 222 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 AMNQ9BXJ7 453 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 HPSEQ9Y251 543 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 KINO60870 393 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 RPS6KA5O75582 802 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SMC2O95347 1197 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TBC1D8O95759 1140 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 BMP15O95972 392 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 HMGCS2P54868 508 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USH1GQ495M9 461 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FBXO11Q86XK2 927 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TBCKQ8TEA7 893 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CUL5Q93034 780 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 KIFC2Q96AC6 838 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FAM107BQ9H098 131 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 OTOFQ9HC10 1997 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 PLA2G6O60733 806 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SASH3O75995 380 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 VCAM1P19320 739 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ZNF165P49910 485 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 BIRC2Q13490 618 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 CSRNP2Q9H175 543 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ELP3Q9H9T3 547 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 KCND1Q9NSA2 647 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 FEM1BQ9UK73 627 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L15C9J2P7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 C19orf81C9J6K1 198 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L11C9JVI0 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L18D6R9N7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L22D6RA61 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L19D6RCP7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L20D6RJB6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 H0YHG0 523 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 NRDCO43847 1150 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 ZNF202O95125 648 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L24Q0WX57 530 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 SEMA3FQ13275 785 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 LETM2Q2VYF4 491 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 USP49Q70CQ1 688 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-210ENST00000453727 NEK8Q86SG6 692 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms