RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC17Q96LX7 622 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 IL25Q9H293 177 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 RAD50Q92878 1312 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CEP250Q9BV73 2442 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 F5H6K3 240 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 H3BNC9 293 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 GOLIM4O00461 696 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TBX10O75333 385 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CXCL10P02778 98 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CHMP4BP1P59074 171 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 KLRC3Q07444 240 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 DUSP28Q4G0W2 176 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TICAM2Q86XR7 235 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 IGFLR1Q9H665 355 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CD207Q9UJ71 328 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 INSL6Q9Y581 213 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SPTBN2O15020 2390 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 USP17L12C9JPN9 530 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 USP17L21D6R901 530 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 NCK2O43639 380 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CSPG5O95196 566 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PDE6AP16499 860 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.511e-8■■■□□ 15.9
ATG4B-211ENST00000429899 HYAL1Q12794 435 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf60Q5U649 245 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CASC1Q6TDU7 716 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 AFAP1L1Q8TED9 768 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ACAD9Q9H845 621 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ARMT1Q9H993 441 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LAMA4Q16363 1823 aa11.87□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 A0A0D9SFI3 127 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 HIP1O00291 1037 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LINC01565O15544 149 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SGSM2O43147 1006 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CHGBP05060 677 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SELPP16109 830 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CPT1AP50416 773 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 NUBP1P53384 320 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 OAZ1P54368 228 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 IKBKEQ14164 716 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PTGISQ16647 500 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 SAMD11Q96NU1 681 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 RNF146Q9NTX7 359 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 USP24Q9UPU5 2620 aa11.86□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 ST3GAL2Q16842 350 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MCTP2Q6DN12 878 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM192Q8IY95 271 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CAGE1Q8TC20 777 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MORC4Q8TE76 937 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 FAM227BQ96M60 508 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 VTA1Q9NP79 307 aa11.85□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 EFCAB14O75071 495 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 CKBP12277 381 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFV1P49821 464 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 MBTPS1Q14703 1052 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.84□□□□□ -0.51
ATG4B-211ENST00000429899 FBXO11Q86XK2 927 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms