RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMIM25-201ENST00000421019 INSL6Q9Y581 213 aa12.72□□□□□ -0.37
SMIM25-201ENST00000421019 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
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SMIM25-201ENST00000421019 LINC01553A4QN01 128 aa12.71□□□□□ -0.37
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