RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ6P48051 423 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6KQ17RY6 165 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCA1Q86XH1 822 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D5Q92609 795 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LNPKQ9C0E8 428 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAT14Q9H8E8 782 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL20A1Q9P218 1284 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM4AO75164 1064 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDSP20132 328 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNQ1P51787 676 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAT2BQ92831 832 aa15.4■□□□□ 0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLL1O43897 1013 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBL2Q08999 1139 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STXBP2Q15833 593 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT40Q6A162 431 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST3Q7LGC8 479 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IWS1Q96ST2 819 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMDN3Q96TC7 470 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.39■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELPP16109 830 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRB10Q13322 594 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPNMBQ14956 572 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGKDQ16760 1214 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKS1AQ92625 1134 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COG5Q9UP83 839 aa15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4E1Z4 1266 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRED2Q7Z698 418 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO11Q86XK2 927 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCHNA4D1U4 455 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPXNO60711 386 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F2P00734 622 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL10P02778 98 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSEN2P49810 448 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf31Q8N865 590 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXMP2Q9NR77 195 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.36■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBNO60934 754 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFBP00751 764 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR3C2P08235 984 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF286BP0CG31 522 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKBP12277 381 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB103AP81534 67 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMC5Q8IY18 1101 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPTC7Q8NI37 304 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG1Q9BT22 464 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIP14410 1827 aa15.35■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAS3O00219 553 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B4P51659 736 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GHRHRQ02643 423 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTK7Q13308 1070 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMC2Q13753 1193 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD10Q14728 455 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-CQ95604 372 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.34■□□□□ 0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMNQ9BXJ7 453 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms