RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52Z1P0C646 297 aa19.2■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.2■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR16Q569H4 304 aa19.19■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM60Q9H2L4 133 aa19.19■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASTN1O14525 1302 aa19.18■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQ27 194 aa19.18■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQ64 194 aa19.18■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF22Q14807 665 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNPTABQ3T906 1256 aa19.17■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2W1Q8TAV3 490 aa19.17■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MORC4Q8TE76 937 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPRASP2Q96D09 838 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDHR1Q96JP9 859 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGD4Q96M96 766 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT12Q9BQG2 462 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXC6P09630 235 aa19.16■□□□□ 0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP2K5Q13163 448 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR1Q13613 665 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 HAS1Q92839 578 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 VWA3AA6NCI4 1184 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSH4O15457 936 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMA1P23946 247 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 TXKP42681 527 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP6NLQ92738 828 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK8Q96MA6 479 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIC6Q96NY7 704 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB34Q9BZG1 259 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHA12Q9UN75 941 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBD3O95983 291 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS2P41220 211 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMC4P43686 418 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDIA5Q14554 519 aa19.14■□□□□ 0.65
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