RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419059.1

SLC19A3-204, Transcript of solute carrier family 19 member 3, human

TSL 1 (best)

Gene SLC19A3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC19A3-204	ENST00000419059	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	PTGS1	P23219	599 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	HSPA4	P34932	840 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	BEX3	Q00994	111 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SLC19A3-204	ENST00000419059		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ZEB2	O60315	1214 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CABYR	O75952	493 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SLC34A2	O95436	690 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CLTB	P09497	229 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TLE2	Q04725	743 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	STXBP2	Q15833	593 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ARVCF	O00192	962 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ARIH2	O95376	493 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	NR3C2	P08235	984 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CPT1A	P50416	773 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CDK7	P50613	346 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	RCAN1	P53805	252 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	ZBTB43	O43298	467 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PGM5	Q15124	567 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	RTN1	Q16799	776 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	COPS5	Q92905	334 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	NID2	Q14112	1375 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	DPYSL4	O14531	572 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CPA1	P15085	419 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PSMA5	P28066	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	CCND2	P30279	289 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SLC19A3-204	ENST00000419059	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2

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