RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK7P50613 346 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NTRK3Q16288 839 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2SQ16763 222 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 BARHL2Q9NY43 387 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NID2Q14112 1375 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH6P13533 1939 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SMCO2A6NFE2 343 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 A6NJR5 290 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 STXBP3O00186 592 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ARVCFO00192 962 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GH1P01241 217 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PHKBQ93100 1093 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TOX2Q96NM4 488 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL3P08590 195 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TGFB3P10600 412 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SCG2P13521 617 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17RAQ96F46 866 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PPFIA3O75145 1194 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 STAM2O75886 525 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNAR1P17181 557 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP1Q07960 439 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 STK3Q13188 491 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGA7Q13683 1181 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PKN1Q16512 942 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf34Q49A92 452 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 AFG1LQ8WV93 481 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GDF15Q99988 308 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN2DO15399 1336 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 KPNA6O60684 536 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY7P51828 1080 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMC6P62333 389 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SP2Q02086 613 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FAAP100Q0VG06 881 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMC2Q13753 1193 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRO3102Q9H379 93 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CLTBP09497 229 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GNPTABQ3T906 1256 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ALPK3Q96L96 1907 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CPLX1O14810 134 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ICAM3P32942 547 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP8BP34820 402 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD1Q15327 319 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 AK2P54819 239 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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