RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401596.1

CNN3P1-201, Transcript of calponin 3 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CNN3P1, Length 935 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3P1-201ENST00000401596 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 FEM1BQ9UK73 627 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 DOCK1Q14185 1865 aa8.36□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 STAT2P52630 851 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 LETM2Q2VYF4 491 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 HYIQ5T013 277 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MLKLQ8NB16 471 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 LRRC15Q8TF66 581 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 C12orf42Q96LP6 360 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 GSDMAQ96QA5 445 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 DISC1Q9NRI5 854 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 RNF186Q9NXI6 227 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF536O15090 1300 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 TBX3O15119 743 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SLC37A4O43826 429 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 TDP2O95551 362 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SREBF1P36956 1147 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF75DP51815 510 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 UBE2SQ16763 222 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 Q4G0T1 1027 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 DCAF15Q66K64 600 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 HAS1Q92839 578 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 SMARCE1Q969G3 411 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 DHX58Q96C10 678 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MED15Q96RN5 788 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ANO3Q9BYT9 981 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 MAF1Q9H063 256 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 CACNA1AO00555 2505 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3P1-201ENST00000401596 PARP14Q460N5 1801 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 ABCB11O95342 1321 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 A0A087WWV3 80 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 SMTNL1A8MU46 457 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L15C9J2P7 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L11C9JVI0 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L18D6R9N7 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L22D6RA61 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L19D6RCP7 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L20D6RJB6 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 KLRC4O43908 158 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 SMC2O95347 1197 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 FDX1P10109 184 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 INPP5BP32019 993 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 TXLNAP40222 546 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 EPS15P42566 896 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP14P54578 494 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L24Q0WX57 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 CUL4BQ13620 913 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 KCNB1Q14721 858 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 PDILTQ8N807 584 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 LENG9Q96B70 501 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 PNMA2Q9UL42 364 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 RLFQ13129 1914 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 RPTORQ8N122 1335 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 PP2D1A8MPX8 630 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 C19orf81C9J6K1 198 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3P1-201ENST00000401596 ICAM1P05362 532 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms