RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 NLRP3Q96P20 1036 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SH3GL2Q99962 352 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 GPTP24298 496 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 ST5P78524 1137 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SLC15A2Q16348 729 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM266Q2M3C6 531 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 UNC13DQ70J99 1090 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CAVIN3Q969G5 261 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 PAGR1Q9BTK6 254 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 TRIM31Q9BZY9 425 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 TRIM4Q9C037 500 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 BARHL2Q9NY43 387 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 BTNL10A8MVZ5 291 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SMIM24O75264 130 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 VSNL1P62760 191 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SPDYCQ5MJ68 293 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CD302Q8IX05 232 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 MIPOL1Q8TD10 442 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 NELFBQ8WX92 580 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 KAT14Q9H8E8 782 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 VPS54Q9P1Q0 977 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 PAPPAQ13219 1627 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 FOXN1O15353 648 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 EHHADHQ08426 723 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SEPT14Q6ZU15 432 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC25Q86WR0 208 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 VCXQ9H320 206 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SENP2Q9HC62 589 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SETSIPP0DME0 302 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 GUCY1A2P33402 732 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 WHAMMQ8TF30 809 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CALML4Q96GE6 196 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 PLIN2Q99541 437 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 MTRQ99707 1265 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 TJP1Q07157 1748 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CLTAP09496 248 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 ERVK-24P63145 666 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 PAK2Q13177 524 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC38Q502W7 563 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 STMN2Q93045 179 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 ADRA2BP18089 450 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 GRIN1Q05586 938 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 HSPA6P17066 643 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 OXER1Q8TDS5 423 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 STIM2Q9P246 746 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 SPAG5Q96R06 1193 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 TBX3O15119 743 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-205ENST00000397611 SEPT6Q14141 434 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 DRP2Q13474 957 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-205ENST00000397611 MYBPC2Q14324 1141 aa5.98□□□□□ -1.45
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