RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 NEK9Q8TD19 979 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TBC1D5Q92609 795 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ANKS1AQ92625 1134 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 FSD1Q9BTV5 496 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 DCTPP1Q9H773 170 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.88■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 POTEB3A0JP26 581 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 GH1P01241 217 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ALADP13716 330 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 HIC1Q14526 733 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 POTEBQ6S5H4 581 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CHST3Q7LGC8 479 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 FBXL18Q96ME1 805 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 COL20A1Q9P218 1284 aa15.87■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF543Q08ER8 600 aa15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 IKBKEQ14164 716 aa15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 USH1GQ495M9 461 aa15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CRBNQ96SW2 442 aa15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CPVLQ9H3G5 476 aa15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 DCXO43602 365 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF286BP0CG31 522 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 SNHG28P0DPA3 235 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PSEN2P49810 448 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PTK7Q13308 1070 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 C7orf31Q8N865 590 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ALG1Q9BT22 464 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 INSL6Q9Y581 213 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.85■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 HAS3O00219 553 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 EFCAB14O75071 495 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 LGR5O75473 907 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 F2P00734 622 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZP2Q05996 745 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 MFSD10Q14728 455 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 EPC2Q52LR7 807 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 RGS22Q8NE09 1264 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TOMM22Q9NS69 142 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PNMA2Q9UL42 364 aa15.84■□□□□ 0.13
CHCHD2-201ENST00000395422 B4DLN1 442 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 COL19A1Q14993 1142 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 DGKDQ16760 1214 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 BANK1Q8NDB2 785 aa15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 H3BNC9 293 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 FGAP02671 866 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 AMHP03971 560 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 SIP14410 1827 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 GPM6BQ13491 265 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 ALX1Q15699 326 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPROQ16827 1216 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 PPTC7Q8NI37 304 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 RMDN3Q96TC7 470 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.81■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 C5orf42Q9H799 3197 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 SORBS3O60504 671 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 IRS1P35568 1242 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 LTBRP36941 435 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 HAND2P61296 217 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 STXBP2Q15833 593 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.8■□□□□ 0.12
CHCHD2-201ENST00000395422 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms