RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 COBLO75128 1261 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC38Q5R3I4 469 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 ERO1AQ96HE7 468 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 ANO3Q9BYT9 981 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 WNT7AO00755 349 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 MCTP2Q6DN12 878 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 RMDN3Q96TC7 470 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 GJD2Q9UKL4 321 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 TRAPPC10P48553 1259 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 DPP9Q86TI2 863 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 ASTN1O14525 1302 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A1B0GVL5 298 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CUTAO60888 179 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP2K5Q13163 448 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF174Q15697 407 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 DNERQ8NFT8 737 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 USP6NLQ92738 828 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 FGD4Q96M96 766 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CLIC6Q96NY7 704 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-204ENST00000373436 CENPFP49454 3210 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 RPTORQ8N122 1335 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXN1O15353 648 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 CMA1P23946 247 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 CAMK4Q16566 473 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PXMP2Q9NR77 195 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 MCM3APO60318 1980 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 HTTP42858 3142 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 UBXN2AP68543 259 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 TBCKQ8TEA7 893 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 GABRQQ9UN88 632 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 BMP15O95972 392 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SREBF1P36956 1147 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 RGS2P41220 211 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 NDUFA8P51970 172 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PRKCZQ05513 592 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 INF2Q27J81 1249 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SHC4Q6S5L8 630 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 TNMDQ9H2S6 317 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 GNRH1P01148 92 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 HOXC6P09630 235 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PGM5Q15124 567 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 KINO60870 393 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PFKFB1P16118 471 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 CYP2B6P20813 491 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 HOXD10P28358 340 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 MCM7P33993 719 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 FLT3LGP49771 235 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGAP4P98171 946 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGEF6Q15052 776 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 IL31RAQ8NI17 732 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 MAML3Q96JK9 1138 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 APBA2Q99767 749 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SRRDQ9UH36 339 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 GRIN1Q05586 938 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 RESP18Q5W5W9 173 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 NR3C2P08235 984 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-204ENST00000373436 PTGDRQ13258 359 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.1 ms