RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 BANK1Q8NDB2 785 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 LRP6O75581 1613 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEB2H3BUK9 544 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 GJC1P36383 396 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DNM2P50570 870 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP4P98171 946 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SPP2Q13103 211 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 MTMR2Q13614 643 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ODR4Q5SWX8 454 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RAD54LQ92698 747 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA1Q92805 767 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POLD4Q9HCU8 107 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 CLIC2O15247 247 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 CDR1P51861 262 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NTRK3Q16288 839 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 MAP9Q49MG5 647 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DESP17661 470 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 MAP3K14Q99558 947 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 GINS2Q9Y248 185 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEB3A0JP26 581 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTECB2RU33 542 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 MCM3P25205 808 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEBQ6S5H4 581 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 USP49Q70CQ1 688 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 METTL13Q8N6R0 699 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SYNCQ9H7C4 482 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PRCPP42785 496 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 MYL1P05976 194 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 TNFAIP3P21580 790 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 WDR44Q5JSH3 913 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 VSTM4Q8IW00 320 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DDX12PQ92771 950 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 TRPC6Q9Y210 931 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 IGSF3O75054 1194 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 OSBPP22059 807 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RASSF7Q02833 373 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NYAP2Q9P242 653 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 VWA3BQ502W6 1294 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ATRNO75882 1429 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEFA5A3E0 1075 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEIP0CG38 1075 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NR2F2P24468 414 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 CETN2P41208 172 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEGQ6S5H5 508 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 FAM151AQ8WW52 585 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PNMA2Q9UL42 364 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 KRT31Q15323 416 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SLC51AQ86UW1 340 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DEPTORQ8TB45 409 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PKN1Q16512 942 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC51Q96ER9 411 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 DYDC2Q96IM9 177 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.05□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTPAL-202ENST00000372904 NACC1Q96RE7 527 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms