RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 CPDO75976 1380 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CREB3O43889 395 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GDF11O95390 407 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RESP18Q5W5W9 173 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TSC22D3Q99576 134 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 COA1Q9GZY4 146 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PNMA2Q9UL42 364 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 VSTM4Q8IW00 320 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CD19P15391 556 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB16Q05516 673 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DEPTORQ8TB45 409 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GLG1Q92896 1179 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 AGLP35573 1532 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 BMP3P12645 472 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CLUL1Q15846 466 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ODR4Q5SWX8 454 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RETREG2Q8NC44 543 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 BUB1O43683 1085 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 H2AFZP0C0S5 128 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RCAN1P53805 252 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 H2AFVQ71UI9 128 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ADGRB1O14514 1584 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 NR2F2P24468 414 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 E2F5Q15329 346 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC41Q15345 812 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 KCNK3O14649 394 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PPFIA2O75334 1257 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PLCG1P19174 1290 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CDC27P30260 824 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CDC23Q9UJX2 597 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CSADQ9Y600 493 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 USTQ9Y2C2 406 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCNE1P24864 410 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CLCN6P51797 869 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MUM1Q2TAK8 710 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SARM1Q6SZW1 724 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 NPR1P16066 1061 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MAN2A1Q16706 1144 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SLC35F6Q8N357 371 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ATP5DP30049 168 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC63Q8NA47 563 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 NBPF3Q9H094 633 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FAM170AA1A519 330 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SLC8A3P57103 927 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SRLQ86TD4 932 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CD209Q9NNX6 404 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DISC1Q9NRI5 854 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 KRT19P08727 400 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 UBXN2AP68543 259 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 23.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms